染料與 RNA 特異性結合：試劑盒中的熒光染料能夠特異性地結合到 RNA 分子上。這種染料具有特殊的結構和性質，它可以插入到 RNA 的雙鏈區域或與 RNA 的特定結構域相互作用，而且結合的程度與 RNA 的量成正比。

熒光信號產生與檢測：當熒光染料結合到 RNA 上后，在特定波長的激發光照射下，染料會被激發并發出熒光。Qubit 儀器能夠精確地檢測到這種熒光信號的強度。由于熒光信號強度與結合的染料量成正比，而染料量又與 RNA 的量成正比，所以通過檢測熒光信號強度就可以準確地測定 RNA 的濃度。

RNA 質量評估：該試劑盒不僅可以檢測 RNA 濃度，還能評估 RNA 的質量。它是通過檢測不同大小 RNA 片段所產生的熒光信號分布來實現的。例如，完整的核糖體 RNA（rRNA）包括 28S rRNA 和 18S rRNA 等，它們的大小不同。在正常情況下，細胞內的 rRNA 含量相對穩定，且 28S rRNA 與 18S rRNA 的比值也較為固定。當 RNA 發生降解時，rRNA 會斷裂成較小的片段，導致 28S rRNA 與 18S rRNA 的比值發生變化，以及 RNA 完整性指數（RIN）改變。Qubit RNA IQ Assay Kit 通過分析熒光信號在不同大小片段上的分布情況，計算出 RIN 值和 28S/18S 比值等參數，從而評估 RNA 的質量和完整性。