優點：葡萄糖是微生物最易利用的碳源之一，幾乎所有的微生物都能利用葡萄糖進行生長代謝。其分子結構簡單，可直接進入細胞內參與糖酵解（EMP）途徑、磷酸戊糖途徑（PPP）等代謝過程，快速為微生物生長提供能量和生物合成的前體物質 。在發酵初期添加葡萄糖，能夠促進微生物快速進入對數生長期，縮短發酵周期。此外，葡萄糖的代謝速率快，可通過調節其添加量和添加方式，精確控制微生物的生長速率和代謝方向，適用于對發酵進程要求嚴格的發酵過程，如氨基酸發酵、抗生素發酵等 。

缺點：葡萄糖的快速利用可能引發 “葡萄糖效應"，即當葡萄糖存在時，會抑制微生物對其他碳源（如乳糖、麥芽糖等）的利用，導致發酵后期營養失衡 。在一些次級代謝產物（如抗生素）發酵中，葡萄糖的過量快速消耗會使微生物生長過于旺盛，大量能量用于菌體生長，而抑制次級代謝產物的合成。此外，葡萄糖價格相對較高，在大規模工業發酵中，使用葡萄糖作為單一碳源會增加生產成本 。

優點：果糖的甜度高，且在水溶液中的溶解度比葡萄糖高，能夠為微生物提供豐富的能量 。對于一些對滲透壓敏感的微生物，果糖可在提供能量的同時，維持細胞內外的滲透壓平衡，有利于微生物的生長。此外，果糖在代謝過程中，部分代謝途徑與葡萄糖不同，可通過多元醇途徑等進行代謝，為微生物提供多樣化的代謝中間產物，有助于某些特殊代謝產物的合成 。

缺點：果糖的代謝速度相對較慢，在發酵初期不能像葡萄糖那樣快速促進微生物生長，可能延長發酵周期 。同時，果糖容易與氨基酸等含氮化合物發生美拉德反應，在高溫發酵過程中，會導致發酵液顏色變深，影響產品質量，尤其對于對色澤要求較高的發酵產品（如食品發酵），這一問題更為突出 。

優點：蔗糖由葡萄糖和果糖組成，是一種優質的碳源，其化學性質穩定，便于儲存和運輸 。在發酵過程中，蔗糖可被微生物分泌的蔗糖酶水解為葡萄糖和果糖，緩慢釋放單糖供微生物利用，從而避免了葡萄糖效應的快速發生，有利于維持發酵過程的穩定性 。蔗糖廣泛應用于食品發酵（如釀酒、酸奶發酵）和一些工業發酵中，能夠為微生物提供持續的能量供應，促進發酵產物的形成 。

缺點：由于蔗糖需要先水解為單糖才能被微生物利用，其代謝啟動速度相對較慢，在發酵初期可能無法滿足微生物快速生長的需求 。此外，蔗糖價格相對較高，且在一些發酵過程中，過量的蔗糖可能導致發酵液滲透壓過高，抑制微生物的生長 。

優點：麥芽糖由兩分子葡萄糖通過 α - 1,4 糖苷鍵連接而成，在淀粉酶的作用下可水解為葡萄糖。麥芽糖的利用速度相對較慢，不會像葡萄糖那樣引起代謝過快，適合用于一些需要緩慢供能的發酵過程，如某些傳統發酵食品（如醬油、豆豉）的發酵 。在這些發酵過程中，麥芽糖的緩慢釋放能夠維持微生物的持續生長和代謝，促進風味物質的形成 。

缺點：并非所有微生物都能直接利用麥芽糖，部分微生物需要分泌麥芽糖酶將其水解為葡萄糖才能利用，這限制了其在一些微生物發酵中的應用 。而且，麥芽糖的市場供應相對有限，價格也較高，在大規模工業發酵中的使用成本較高 。

優點：淀粉來源廣泛，價格低廉，是工業發酵中常用的碳源之一 。它是由葡萄糖聚合而成的高分子化合物，在微生物分泌的淀粉酶作用下，逐步水解為麥芽糖、葡萄糖等小分子糖類被利用 。由于淀粉的緩慢水解特性，能夠持續為微生物提供碳源，避免了代謝過快和葡萄糖效應的產生，有利于維持發酵過程的穩定 。在抗生素、氨基酸、有機酸等發酵生產中廣泛應用，可有效降低生產成本 。

缺點：淀粉的水解過程需要微生物分泌淀粉酶，對于一些淀粉酶分泌能力弱的微生物，淀粉的利用效率較低 。而且，淀粉的水解過程可能受到溫度、pH 值等因素的影響，水解可能導致發酵液中殘留大量淀粉，影響發酵產物的分離純化 。此外，淀粉在水中的溶解性較差，需要進行預處理（如糊化、液化）才能更好地被微生物利用，增加了發酵工藝的復雜性和成本 。

優點：纖維素是地球上可再生資源，來源廣泛且價格低廉 。利用纖維素作為碳源進行發酵，不僅可以降低生產成本，還能實現資源的可持續利用，符合綠色化學和循環經濟的理念 。對于一些能夠分泌纖維素酶的微生物（如纖維素分解菌），纖維素可作為良好的碳源，用于生產生物燃料（如乙醇）、生物基材料等 。

缺點：纖維素的結構復雜，由葡萄糖通過 β - 1,4 糖苷鍵連接而成，并形成高度結晶的纖維束，難以被一般微生物直接利用 。需要高效的纖維素酶將其水解為葡萄糖，而纖維素酶的生產成本較高，且水解效率較低，限制了纖維素在發酵工程中的大規模應用 。此外，纖維素的預處理過程（如物理處理、化學處理、生物處理）也較為復雜，增加了工藝難度和成本 。

缺點：甘油的氧化分解過程相對復雜，需要經過多個酶促反應，部分微生物對甘油的利用效率較低 。而且，甘油的價格相對較高，在大規模工業發酵中，使用甘油作為主要碳源會增加生產成本 。此外，甘油在發酵過程中可能會積累一些中間代謝產物，影響發酵過程的正常進行和發酵產物的質量 。

缺點：乙醇具有一定的毒性，高濃度的乙醇會抑制微生物的生長和代謝 。在發酵過程中，需要嚴格控制乙醇的濃度，避免對微生物產生毒害作用 。而且，乙醇的揮發性較強，在發酵過程中容易揮發損失，增加了發酵工藝控制的難度和生產成本 。此外，乙醇作為碳源時，其代謝產物相對單一，可能無法滿足微生物對多種代謝前體物質的需求，限制了某些復雜代謝產物的合成 。

缺點：醋酸具有較強的酸性，高濃度的醋酸會降低發酵液的 pH 值，抑制微生物的生長 。在發酵過程中，需要嚴格控制醋酸的濃度和發酵液的 pH 值，增加了發酵工藝控制的難度 。而且，醋酸的價格相對較高，在大規模工業發酵中，使用醋酸作為主要碳源會增加生產成本 。此外，醋酸作為碳源時，其代謝產物相對單一，可能無法滿足微生物對多種營養物質的需求 。

缺點：乳酸的積累會導致發酵液 pH 值下降，當 pH 值過低時，會抑制微生物的生長和代謝 。在發酵過程中，需要及時控制乳酸的積累，如通過中和劑調節 pH 值，這增加了發酵工藝的復雜性和成本 。而且，乳酸的代謝途徑相對單一，在一些需要多種代謝前體物質的發酵過程中，可能無法滿足微生物的需求 。此外，乳酸的價格波動較大，受原料供應和市場需求的影響明顯，增加了生產成本控制的難度 。