細胞樣本：若為普通哺乳動物細胞，常規的 Western 裂解液即可滿足需求，如含 SDS、Tris - HCl、NaCl 等成分的裂解液，能有效裂解細胞并使蛋白質變性，適用于后續 Western Blot 檢測蛋白表達水平 。對于懸浮細胞，需注意裂解液的用量和裂解時間，避免因細胞量少導致蛋白質提取不充分；貼壁細胞則可直接在培養板中加入裂解液裂解，方便快捷。若為原代細胞，因其較為脆弱，宜選用溫和的裂解液，減少對細胞內蛋白質結構的破壞，維持蛋白質的天然狀態，為研究蛋白質功能和相互作用保留更多信息。

組織樣本：由于組織細胞間結構緊密，需選擇裂解能力更強的裂解液。對于軟組織，如肝臟、脾臟等，可使用添加了蛋白酶 K 等消化酶的裂解液，幫助分解細胞間質，促進細胞裂解和蛋白質釋放；對于肌肉、皮膚等纖維成分較多的組織，可能需要配合機械勻漿或超聲破碎等物理方法，同時搭配裂解液，以提高蛋白質提取效率。此外，針對植物組織樣本，因其細胞壁的存在，需選擇含有纖維素酶、果膠酶等成分的裂解液，先破除細胞壁，再裂解細胞提取蛋白質。

蛋白質表達分析（Western Blot）：主要關注蛋白質的完整提取和充分變性，以便在 SDS - PAGE 電泳中按分子量大小分離。此時，可選用含強離子型表面活性劑（如 SDS）的 Western 裂解液，確保蛋白質變性，同時添加蛋白酶抑制劑，防止蛋白質降解。若研究磷酸化蛋白質，還需加入磷酸酶抑制劑，保持蛋白質的磷酸化修飾狀態，準確檢測磷酸化蛋白的表達水平。

蛋白質相互作用研究（IP）：重點在于保持蛋白質的天然構象，使蛋白質間的相互作用得以保留。因此，應選擇溫和的 IP 裂解液，如含 Triton X - 100、NP - 40 等非離子型表面活性劑的裂解液，既能裂解細胞，又能維持蛋白質的空間結構和相互作用位點。此外，為減少非特異性結合，裂解液中可適當降低鹽濃度或添加適量的 BSA 等封閉劑，提高免疫沉淀實驗的特異性。

蛋白質純化：若需從細胞或組織中純化特定蛋白質，需考慮裂解液對目標蛋白質活性和純度的影響。可選擇不影響目標蛋白質活性且能有效去除雜質蛋白的裂解液，同時，根據后續純化方法（如親和層析、離子交換層析等），確保裂解液成分與純化過程兼容，避免對純化步驟產生干擾。

蛋白質穩定性：對于不穩定或易降解的蛋白質，如某些轉錄因子、信號蛋白等，需選擇含有高效蛋白酶抑制劑的裂解液，抑制細胞內蛋白酶的活性，防止蛋白質在裂解過程中被降解。同時，在操作過程中盡量保持低溫，減少蛋白質降解的風險。

蛋白質溶解性：若目標蛋白質為膜蛋白或疏水蛋白，普通裂解液可能難以使其充分溶解。此時，可選擇含有較強去垢劑（如 CHAPS、Sarkosyl）的裂解液，增強蛋白質的溶解性；對于親水蛋白，常規裂解液即可滿足需求，但需注意裂解液的離子強度，避免因離子強度過高導致蛋白質沉淀。

蛋白質修飾狀態：當研究蛋白質的磷酸化、糖基化等修飾時，除了添加相應的磷酸酶抑制劑、糖苷酶抑制劑外，還需選擇不會破壞蛋白質修飾結構的裂解液。例如，在研究蛋白質磷酸化時，避免使用會導致蛋白質過度變性的強堿性裂解液，以免破壞磷酸化位點，影響實驗結果的準確性。

實驗成本：不同品牌和類型的裂解液價格存在差異，在滿足實驗需求的前提下，可綜合考慮成本因素選擇合適的裂解液。對于大規模實驗或預算有限的情況，可選擇性價比高的產品；對于重要的關鍵實驗，可優先考慮質量可靠的品牌裂解液，確保實驗結果的準確性和可靠性。

裂解液兼容性：確保所選裂解液與后續實驗中使用的試劑、儀器等兼容。例如，若后續需進行質譜分析，裂解液中的成分不能干擾質譜檢測；若使用特定的抗體進行免疫檢測，裂解液不能影響抗體與抗原的結合活性。在進行新的實驗或使用新的裂解液時，建議先進行小規模預實驗，驗證裂解液的適用性和兼容性。